鄂尔多斯市蒙医医院传统疗术科创建于2004年，是蒙药配合蒙医传统疗术为主，突出鄂尔多斯蒙医特色，集治疗与科研为一体的综合科室。规模由原来200平米扩大到2200多平米。现有床位40张，医护人员23名，其中主任医师2名、主治医师5名、住院医师5名、确有专长医师1名、主管护师7名、护师2名、护理员1名。自治区名蒙医2名、文化部命名的传统医学非物质文化遗产保护与传承教育首席专家1名、自治区非物质文化传承人1名、蒙医温针流派传承人5名、内蒙古自治区老中医药（蒙医药）专家学术经验继承人指导老师2名、硕士生导师2名。2017年被评为内蒙古自治区蒙医茶酒疗术重点学科，2019年被评为鄂尔多斯市蒙医茶酒疗术重点学科，2020年被评为鄂尔多斯市创新创业人才团队，2022年被评为第二批自治区蒙医临床重点专科建设项目，2024年被评为鄂尔多斯市（优势）重点专科建设项目。先后成立了国家级非物质文化遗产《赞巴拉道尔吉温针、火针疗法》传承人乌兰工作室、国家岐黄学者乌兰工作室、内蒙古自治区名蒙医孟柯学术经验传承工作室、蒙医五疗温针流派传承工作室鄂尔多斯市蒙医医院工作站等。本科室已申请内蒙古自治区级非物质文化遗产项目《羊下颌骨刮痧治疗颈椎“查干胡英”病》《蒙医体质辨识》2项，鄂尔多斯市级非物质文化遗产项目《羊下颌骨刮痧治疗颈椎“查干胡英”病》《蒙医体质辨识》《蒙医传统鄂尔多斯茶酒疗法》《蒙医传统颐润（油疗）疗法》《协日素疗法》《蒙古灸》等6项。

科室主要以蒙药配合茶酒疗法、诺哈拉呼（手法按摩疗法）、哈图哈呼（针刺疗法）、蒙古灸、药浴、泥疗、沙疗、烟熏疗、放血、震术、涂擦疗法、刮痧、贴敷疗法等百余种蒙医传统疗法治疗颈腰椎病、关节炎、不消症、脏腑疾病、脑血管病、高血压病、高脂血症、糖尿病等疾病。科室优势病种有颈椎病、腰椎椎间盘突出症、双膝骨性关节炎、慢性阻塞性肺病、胃衰症等疾病，常见病和多发病有脑梗塞、脑出血、面瘫、类风湿性关节炎、风湿性关节炎、痛风、肩周炎、下肢静脉曲张、带状疱疹、高血压病、高脂血症、糖尿病等疾病。

本科室本着人才培养的宗旨，先后选派数名医护人员到解放军总医院第一附属医院、中日友好医院、中国中医科学院望京医院、内蒙古医学院第一附属医院、鄂尔多斯市中心医院进修学习。科室先后主持或参与国家级科研项目4项，自治区级、市级科研项目10余项。主编和参编著作有《蒙医药文化图解》《疗术行悟》等7部，发表国家级期刊论文约40余篇。